Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC18A3Q16572 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms