Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CNGA3Q16281 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CNGA3Q16281 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CNGA3Q16281 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CNGA3Q16281 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGA3Q16281 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
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