Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms