Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF56Q15929 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF56Q15929 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF56Q15929 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF56Q15929 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF56Q15929 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF56Q15929 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF56Q15929 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF56Q15929 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF56Q15929 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF56Q15929 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF56Q15929 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF56Q15929 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF56Q15929 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms