Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF1Q15637 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF1Q15637 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF1Q15637 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF1Q15637 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF1Q15637 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF1Q15637 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF1Q15637 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF1Q15637 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF1Q15637 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF1Q15637 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF1Q15637 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF1Q15637 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SF1Q15637 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF1Q15637 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF1Q15637 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF1Q15637 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF1Q15637 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF1Q15637 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF1Q15637 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF1Q15637 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF1Q15637 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF1Q15637 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF1Q15637 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF1Q15637 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF1Q15637 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF1Q15637 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF1Q15637 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF1Q15637 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF1Q15637 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF1Q15637 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF1Q15637 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF1Q15637 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF1Q15637 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF1Q15637 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF1Q15637 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF1Q15637 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF1Q15637 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF1Q15637 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF1Q15637 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF1Q15637 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF1Q15637 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF1Q15637 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF1Q15637 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF1Q15637 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF1Q15637 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF1Q15637 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF1Q15637 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF1Q15637 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF1Q15637 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF1Q15637 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF1Q15637 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF1Q15637 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF1Q15637 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF1Q15637 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF1Q15637 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF1Q15637 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF1Q15637 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF1Q15637 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF1Q15637 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF1Q15637 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF1Q15637 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF1Q15637 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF1Q15637 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF1Q15637 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF1Q15637 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF1Q15637 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF1Q15637 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF1Q15637 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF1Q15637 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SF1Q15637 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF1Q15637 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF1Q15637 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF1Q15637 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF1Q15637 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF1Q15637 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF1Q15637 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF1Q15637 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF1Q15637 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF1Q15637 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF1Q15637 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF1Q15637 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF1Q15637 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF1Q15637 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF1Q15637 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF1Q15637 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF1Q15637 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF1Q15637 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF1Q15637 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF1Q15637 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF1Q15637 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF1Q15637 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF1Q15637 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF1Q15637 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF1Q15637 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF1Q15637 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF1Q15637 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF1Q15637 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF1Q15637 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF1Q15637 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
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