Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHHQ15465 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHHQ15465 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHHQ15465 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHHQ15465 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHHQ15465 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SHHQ15465 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHHQ15465 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHHQ15465 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHHQ15465 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHHQ15465 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SHHQ15465 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SHHQ15465 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SHHQ15465 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SHHQ15465 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHHQ15465 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHHQ15465 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHHQ15465 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHHQ15465 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHHQ15465 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHHQ15465 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHHQ15465 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHHQ15465 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHHQ15465 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHHQ15465 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SHHQ15465 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHHQ15465 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHHQ15465 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHHQ15465 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHHQ15465 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHHQ15465 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHHQ15465 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHHQ15465 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHHQ15465 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHHQ15465 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SHHQ15465 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHHQ15465 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHHQ15465 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHHQ15465 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SHHQ15465 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHHQ15465 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHHQ15465 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHHQ15465 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHHQ15465 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHHQ15465 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHHQ15465 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SHHQ15465 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHHQ15465 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHHQ15465 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHHQ15465 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHHQ15465 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SHHQ15465 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SHHQ15465 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHHQ15465 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHHQ15465 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHHQ15465 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHHQ15465 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHHQ15465 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHHQ15465 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SHHQ15465 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SHHQ15465 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHHQ15465 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SHHQ15465 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SHHQ15465 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHHQ15465 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHHQ15465 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHHQ15465 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHHQ15465 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHHQ15465 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHHQ15465 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHHQ15465 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHHQ15465 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHHQ15465 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHHQ15465 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHHQ15465 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHHQ15465 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHHQ15465 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHHQ15465 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHHQ15465 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHHQ15465 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHHQ15465 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHHQ15465 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHHQ15465 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHHQ15465 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHHQ15465 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHHQ15465 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHHQ15465 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHHQ15465 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHHQ15465 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHHQ15465 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHHQ15465 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHHQ15465 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHHQ15465 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHHQ15465 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHHQ15465 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHHQ15465 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHHQ15465 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHHQ15465 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHHQ15465 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHHQ15465 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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