Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNN3Q15417 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
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