Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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PTPRRQ15256 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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PTPRRQ15256 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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PTPRRQ15256 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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PTPRRQ15256 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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PTPRRQ15256 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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PTPRRQ15256 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PTPRRQ15256 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PTPRRQ15256 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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