Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NCF4Q15080 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCF4Q15080 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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