Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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