Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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RAB39AQ14964 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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RAB39AQ14964 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB39AQ14964 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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RAB39AQ14964 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB39AQ14964 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB39AQ14964 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB39AQ14964 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB39AQ14964 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB39AQ14964 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB39AQ14964 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB39AQ14964 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB39AQ14964 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB39AQ14964 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB39AQ14964 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB39AQ14964 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB39AQ14964 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB39AQ14964 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB39AQ14964 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB39AQ14964 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB39AQ14964 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB39AQ14964 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB39AQ14964 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB39AQ14964 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB39AQ14964 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB39AQ14964 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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RAB39AQ14964 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB39AQ14964 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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