Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSPNQ14714 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSPNQ14714 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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