Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNGB1Q14028 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
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