Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CIRBPQ14011 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms