Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PTCH1Q13635 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
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