Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNW1Q13573 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNW1Q13573 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms