Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TCIRG1Q13488 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCIRG1Q13488 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TCIRG1Q13488 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
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