Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMED1Q13445 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED1Q13445 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
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