Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3B2Q13367 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
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