Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
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