Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MRPL28Q13084 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MRPL28Q13084 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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