Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMAN2Q12907 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN2Q12907 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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