Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms