Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RBBP4Q09028 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms