Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF85Q03923 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF85Q03923 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF85Q03923 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF85Q03923 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF85Q03923 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF85Q03923 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF85Q03923 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF85Q03923 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF85Q03923 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF85Q03923 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF85Q03923 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms