Protein–RNA interactions for Protein: Q02820

NCE101, Non-classical export protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCE101Q02820 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.65□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.65□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.65□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 YNL114CYNL114C 372 nt0.65□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 DSE4YNR067C 3354 nt0.65□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 NUP157YER105C 4176 nt0.65□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 MIG1YGL035C 1515 nt0.64□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 YIL166CYIL166C 1629 nt0.64□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 ALG11YNL048W 1647 nt0.64□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 CNM67YNL225C 1746 nt0.64□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 YDR203WYDR203W 318 nt0.64□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 KEI1YDR367W 666 nt0.64□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.64□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.64□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.64□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.64□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.64□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.64□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 MRPL9YGR220C 810 nt0.64□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 RPL16AYIL133C 600 nt0.64□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 YKL070WYKL070W 510 nt0.64□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 CNS1YBR155W 1158 nt0.64□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 MTL1YGR023W 1656 nt0.64□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 SPO22YIL073C 2928 nt0.64□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 SPP382YLR424W 2127 nt0.64□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 OST1YJL002C 1431 nt0.64□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 ATG9YDL149W 2994 nt0.63□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 NOP6YDL213C 678 nt0.63□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 YHL044WYHL044W 708 nt0.63□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 HTD2YHR067W 843 nt0.63□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 YLR224WYLR224W 1110 nt0.63□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 PAI3YMR174C 207 nt0.63□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 INP1YMR204C 1263 nt0.63□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 YJR039WYJR039W 3366 nt0.63□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 NDC80YIL144W 2076 nt0.63□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 ENP2YGR145W 2124 nt0.62□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 YCS4YLR272C 3531 nt0.62□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 KAP120YPL125W 3099 nt0.62□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 SAE2YGL175C 1038 nt0.62□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 YGL242CYGL242C 546 nt0.62□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 VPS54YDR027C 2670 nt0.62□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 YJL070CYJL070C 2667 nt0.62□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 YJR061WYJR061W 2808 nt0.62□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 PKP2YGL059W 1476 nt0.61□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 PIG2YIL045W 1617 nt0.61□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.61□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 YJL169WYJL169W 369 nt0.61□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.61□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 snR14snR14 160 nt0.61□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 SXM1YDR395W 2835 nt0.61□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 NEM1YHR004C 1341 nt0.61□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 HOS4YIL112W 3252 nt0.6□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 MON2YNL297C 4911 nt0.6□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt0.6□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 SWD3YBR175W 948 nt0.6□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 YJR003CYJR003C 1560 nt0.6□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 YMR160WYMR160W 2451 nt0.6□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 NPL6YMR091C 1308 nt0.6□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 SEC15YGL233W 2733 nt0.59□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 VPS72YDR485C 2388 nt0.59□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 FCF2YLR051C 654 nt0.59□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 MTG1YMR097C 1104 nt0.59□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 IST1YNL265C 897 nt0.59□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 AIM4YBR194W 372 nt0.59□□□□□ -2.31
NCE101Q02820 VHR1YIL056W 1923 nt0.59□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 SEC3YER008C 4011 nt0.58□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 YJR029WYJR029W 5268 nt0.58□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.58□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 AIM11YER093C-A 414 nt0.58□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 YJL015CYJL015C 285 nt0.58□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 RDN58-1RDN58-1 158 nt0.58□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 RDN58-2RDN58-2 158 nt0.58□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 FRQ1YDR373W 573 nt0.57□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 SLX9YGR081C 633 nt0.57□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 ERP1YAR002C-A 660 nt0.57□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 RPS18BYML026C 441 nt0.57□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 CIK1YMR198W 1785 nt0.57□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 GAS2YLR343W 1668 nt0.56□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 TUS1YLR425W 3924 nt0.56□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 TRL1YJL087C 2484 nt0.56□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 YNL234WYNL234W 1281 nt0.56□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 CFT2YLR115W 2580 nt0.56□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 CLB4YLR210W 1383 nt0.56□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 AVT5YBL089W 1380 nt0.56□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 RSM22YKL155C 1887 nt0.55□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 SDT1YGL224C 843 nt0.55□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 URM1YIL008W 300 nt0.55□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 MGE1YOR232W 687 nt0.55□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 APA1YCL050C 966 nt0.55□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 BUD3YCL014W 4911 nt0.55□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 TFC8YPL007C 1767 nt0.55□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 MAL33YBR297W 1407 nt0.55□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 UTP20YBL004W 7482 nt0.54□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.54□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 HIT1YJR055W 495 nt0.54□□□□□ -2.32
NCE101Q02820 HHF1YBR009C 312 nt0.54□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 55.2 ms