Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP4Q02446 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SP4Q02446 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP4Q02446 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP4Q02446 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP4Q02446 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP4Q02446 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP4Q02446 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SP4Q02446 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP4Q02446 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP4Q02446 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP4Q02446 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP4Q02446 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP4Q02446 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP4Q02446 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP4Q02446 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP4Q02446 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP4Q02446 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP4Q02446 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP4Q02446 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP4Q02446 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP4Q02446 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP4Q02446 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP4Q02446 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP4Q02446 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP4Q02446 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP4Q02446 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP4Q02446 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SP4Q02446 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP4Q02446 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP4Q02446 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP4Q02446 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP4Q02446 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP4Q02446 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP4Q02446 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SP4Q02446 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP4Q02446 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP4Q02446 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP4Q02446 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP4Q02446 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP4Q02446 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP4Q02446 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP4Q02446 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SP4Q02446 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP4Q02446 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP4Q02446 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP4Q02446 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP4Q02446 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP4Q02446 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SP4Q02446 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP4Q02446 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP4Q02446 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP4Q02446 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SP4Q02446 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SP4Q02446 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SP4Q02446 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP4Q02446 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP4Q02446 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP4Q02446 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP4Q02446 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP4Q02446 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SP4Q02446 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP4Q02446 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP4Q02446 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP4Q02446 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP4Q02446 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP4Q02446 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP4Q02446 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SP4Q02446 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP4Q02446 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP4Q02446 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP4Q02446 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP4Q02446 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP4Q02446 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SP4Q02446 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP4Q02446 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP4Q02446 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP4Q02446 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SP4Q02446 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP4Q02446 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP4Q02446 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP4Q02446 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP4Q02446 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP4Q02446 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP4Q02446 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP4Q02446 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SP4Q02446 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP4Q02446 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP4Q02446 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP4Q02446 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP4Q02446 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SP4Q02446 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP4Q02446 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP4Q02446 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP4Q02446 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP4Q02446 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP4Q02446 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SP4Q02446 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP4Q02446 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SP4Q02446 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms