Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms