Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSG6Q00889 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSG6Q00889 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSG6Q00889 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSG6Q00889 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSG6Q00889 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSG6Q00889 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSG6Q00889 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSG6Q00889 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSG6Q00889 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.3 ms