Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HDLBPQ00341 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms