Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTG1P63261 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms