Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP46P62068 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP46P62068 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP46P62068 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP46P62068 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP46P62068 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP46P62068 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP46P62068 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP46P62068 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP46P62068 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP46P62068 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP46P62068 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP46P62068 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP46P62068 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP46P62068 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP46P62068 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP46P62068 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP46P62068 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP46P62068 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP46P62068 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP46P62068 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP46P62068 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP46P62068 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP46P62068 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP46P62068 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP46P62068 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP46P62068 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP46P62068 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP46P62068 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP46P62068 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP46P62068 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP46P62068 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP46P62068 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP46P62068 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP46P62068 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP46P62068 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP46P62068 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP46P62068 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP46P62068 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP46P62068 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP46P62068 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP46P62068 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP46P62068 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP46P62068 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP46P62068 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP46P62068 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP46P62068 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP46P62068 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP46P62068 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP46P62068 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP46P62068 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP46P62068 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP46P62068 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP46P62068 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP46P62068 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP46P62068 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP46P62068 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP46P62068 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP46P62068 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP46P62068 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP46P62068 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP46P62068 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP46P62068 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP46P62068 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP46P62068 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP46P62068 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP46P62068 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP46P62068 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP46P62068 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP46P62068 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP46P62068 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP46P62068 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP46P62068 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP46P62068 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP46P62068 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP46P62068 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP46P62068 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP46P62068 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP46P62068 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP46P62068 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP46P62068 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP46P62068 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP46P62068 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP46P62068 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP46P62068 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP46P62068 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP46P62068 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP46P62068 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP46P62068 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP46P62068 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP46P62068 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP46P62068 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP46P62068 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP46P62068 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP46P62068 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP46P62068 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP46P62068 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP46P62068 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP46P62068 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP46P62068 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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