Protein–RNA interactions for Protein: P61018

RAB4B, Ras-related protein Rab-4B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4BP61018 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB4BP61018 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB4BP61018 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB4BP61018 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB4BP61018 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB4BP61018 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB4BP61018 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB4BP61018 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB4BP61018 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB4BP61018 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms