Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVPABLB-1P60509 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVPABLB-1P60509 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms