Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP1P59025 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP1P59025 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP1P59025 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP1P59025 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP1P59025 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP1P59025 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP1P59025 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP1P59025 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP1P59025 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP1P59025 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP1P59025 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP1P59025 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP1P59025 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP1P59025 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP1P59025 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP1P59025 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP1P59025 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP1P59025 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP1P59025 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP1P59025 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP1P59025 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP1P59025 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP1P59025 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP1P59025 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP1P59025 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP1P59025 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP1P59025 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP1P59025 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP1P59025 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP1P59025 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP1P59025 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP1P59025 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP1P59025 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP1P59025 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP1P59025 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP1P59025 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP1P59025 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP1P59025 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP1P59025 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP1P59025 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP1P59025 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP1P59025 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP1P59025 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP1P59025 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP1P59025 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP1P59025 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP1P59025 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP1P59025 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP1P59025 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP1P59025 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTP1P59025 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RTP1P59025 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTP1P59025 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTP1P59025 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTP1P59025 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTP1P59025 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP1P59025 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP1P59025 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP1P59025 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP1P59025 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP1P59025 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP1P59025 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP1P59025 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP1P59025 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP1P59025 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP1P59025 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP1P59025 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP1P59025 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP1P59025 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP1P59025 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP1P59025 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP1P59025 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP1P59025 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP1P59025 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP1P59025 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP1P59025 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP1P59025 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP1P59025 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP1P59025 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP1P59025 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP1P59025 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP1P59025 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP1P59025 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP1P59025 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP1P59025 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP1P59025 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP1P59025 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP1P59025 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP1P59025 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP1P59025 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP1P59025 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP1P59025 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP1P59025 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP1P59025 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP1P59025 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP1P59025 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP1P59025 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP1P59025 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP1P59025 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms