Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RIPK4P57078 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIPK4P57078 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms