Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIPPLY3P57055 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms