Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNB3P54284 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNB3P54284 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms