Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
SMARCA4P51532 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC37.57■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SMARCA4P51532 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms