Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCNN1GP51170 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCNN1GP51170 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms