Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK7P50613 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK7P50613 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK7P50613 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK7P50613 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK7P50613 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK7P50613 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK7P50613 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK7P50613 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK7P50613 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK7P50613 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CDK7P50613 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK7P50613 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK7P50613 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK7P50613 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK7P50613 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK7P50613 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK7P50613 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK7P50613 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK7P50613 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK7P50613 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK7P50613 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK7P50613 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK7P50613 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK7P50613 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK7P50613 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK7P50613 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK7P50613 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK7P50613 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK7P50613 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK7P50613 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK7P50613 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDK7P50613 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK7P50613 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK7P50613 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDK7P50613 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDK7P50613 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK7P50613 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK7P50613 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK7P50613 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK7P50613 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK7P50613 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK7P50613 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK7P50613 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK7P50613 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK7P50613 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK7P50613 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK7P50613 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK7P50613 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK7P50613 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK7P50613 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK7P50613 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK7P50613 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK7P50613 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK7P50613 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK7P50613 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK7P50613 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDK7P50613 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK7P50613 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK7P50613 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK7P50613 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK7P50613 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK7P50613 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK7P50613 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK7P50613 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK7P50613 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK7P50613 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK7P50613 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK7P50613 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK7P50613 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK7P50613 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK7P50613 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK7P50613 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK7P50613 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDK7P50613 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDK7P50613 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms