Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6P49848 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6P49848 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6P49848 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6P49848 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6P49848 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6P49848 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6P49848 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6P49848 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6P49848 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6P49848 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6P49848 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6P49848 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6P49848 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6P49848 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6P49848 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6P49848 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6P49848 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6P49848 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6P49848 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6P49848 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6P49848 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6P49848 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6P49848 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6P49848 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6P49848 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6P49848 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6P49848 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6P49848 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6P49848 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6P49848 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6P49848 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6P49848 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6P49848 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6P49848 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6P49848 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6P49848 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6P49848 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6P49848 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6P49848 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6P49848 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6P49848 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6P49848 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6P49848 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6P49848 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6P49848 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6P49848 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF6P49848 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF6P49848 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF6P49848 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF6P49848 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF6P49848 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF6P49848 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF6P49848 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF6P49848 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF6P49848 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF6P49848 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF6P49848 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF6P49848 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF6P49848 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TAF6P49848 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TAF6P49848 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TAF6P49848 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TAF6P49848 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TAF6P49848 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TAF6P49848 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF6P49848 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF6P49848 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF6P49848 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF6P49848 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF6P49848 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF6P49848 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF6P49848 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF6P49848 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms