Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPFP49454 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPFP49454 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPFP49454 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPFP49454 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPFP49454 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPFP49454 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPFP49454 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPFP49454 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPFP49454 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPFP49454 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPFP49454 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPFP49454 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPFP49454 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPFP49454 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPFP49454 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPFP49454 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPFP49454 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPFP49454 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPFP49454 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPFP49454 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPFP49454 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPFP49454 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPFP49454 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPFP49454 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPFP49454 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPFP49454 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPFP49454 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPFP49454 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPFP49454 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPFP49454 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPFP49454 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPFP49454 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPFP49454 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPFP49454 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPFP49454 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPFP49454 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPFP49454 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPFP49454 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPFP49454 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPFP49454 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPFP49454 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPFP49454 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPFP49454 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPFP49454 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPFP49454 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPFP49454 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPFP49454 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPFP49454 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPFP49454 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPFP49454 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPFP49454 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPFP49454 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPFP49454 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPFP49454 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPFP49454 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPFP49454 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPFP49454 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPFP49454 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPFP49454 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPFP49454 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPFP49454 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPFP49454 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPFP49454 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPFP49454 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPFP49454 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPFP49454 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPFP49454 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPFP49454 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPFP49454 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPFP49454 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPFP49454 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPFP49454 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPFP49454 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPFP49454 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPFP49454 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPFP49454 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPFP49454 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPFP49454 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPFP49454 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPFP49454 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPFP49454 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPFP49454 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPFP49454 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPFP49454 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPFP49454 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPFP49454 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPFP49454 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPFP49454 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPFP49454 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPFP49454 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPFP49454 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPFP49454 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPFP49454 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPFP49454 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPFP49454 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPFP49454 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPFP49454 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPFP49454 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPFP49454 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms