Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AMPHP49418 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AMPHP49418 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AMPHP49418 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AMPHP49418 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AMPHP49418 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AMPHP49418 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AMPHP49418 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AMPHP49418 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AMPHP49418 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
AMPHP49418 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AMPHP49418 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AMPHP49418 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AMPHP49418 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AMPHP49418 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
AMPHP49418 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AMPHP49418 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AMPHP49418 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AMPHP49418 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AMPHP49418 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AMPHP49418 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AMPHP49418 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AMPHP49418 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AMPHP49418 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AMPHP49418 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AMPHP49418 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AMPHP49418 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AMPHP49418 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AMPHP49418 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AMPHP49418 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AMPHP49418 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AMPHP49418 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
AMPHP49418 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AMPHP49418 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AMPHP49418 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AMPHP49418 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AMPHP49418 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AMPHP49418 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AMPHP49418 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AMPHP49418 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AMPHP49418 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
AMPHP49418 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AMPHP49418 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AMPHP49418 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AMPHP49418 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AMPHP49418 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AMPHP49418 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AMPHP49418 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AMPHP49418 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AMPHP49418 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AMPHP49418 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AMPHP49418 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AMPHP49418 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AMPHP49418 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AMPHP49418 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AMPHP49418 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AMPHP49418 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AMPHP49418 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AMPHP49418 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AMPHP49418 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AMPHP49418 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AMPHP49418 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AMPHP49418 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AMPHP49418 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AMPHP49418 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AMPHP49418 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AMPHP49418 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AMPHP49418 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AMPHP49418 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AMPHP49418 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AMPHP49418 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AMPHP49418 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AMPHP49418 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AMPHP49418 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AMPHP49418 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AMPHP49418 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AMPHP49418 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AMPHP49418 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AMPHP49418 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AMPHP49418 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AMPHP49418 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AMPHP49418 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
AMPHP49418 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AMPHP49418 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
AMPHP49418 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AMPHP49418 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AMPHP49418 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AMPHP49418 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AMPHP49418 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AMPHP49418 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AMPHP49418 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AMPHP49418 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AMPHP49418 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AMPHP49418 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AMPHP49418 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AMPHP49418 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AMPHP49418 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AMPHP49418 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AMPHP49418 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AMPHP49418 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms