Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMTP48728 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AMTP48728 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
AMTP48728 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AMTP48728 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AMTP48728 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMTP48728 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMTP48728 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMTP48728 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMTP48728 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMTP48728 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMTP48728 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMTP48728 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMTP48728 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMTP48728 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMTP48728 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMTP48728 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMTP48728 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMTP48728 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMTP48728 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMTP48728 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMTP48728 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMTP48728 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMTP48728 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMTP48728 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMTP48728 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMTP48728 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMTP48728 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMTP48728 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMTP48728 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMTP48728 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMTP48728 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMTP48728 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMTP48728 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMTP48728 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMTP48728 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMTP48728 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AMTP48728 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMTP48728 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMTP48728 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMTP48728 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMTP48728 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMTP48728 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMTP48728 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMTP48728 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMTP48728 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms