Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA8P48165 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA8P48165 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA8P48165 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA8P48165 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA8P48165 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA8P48165 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA8P48165 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA8P48165 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA8P48165 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA8P48165 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA8P48165 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA8P48165 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA8P48165 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA8P48165 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA8P48165 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA8P48165 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJA8P48165 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA8P48165 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA8P48165 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA8P48165 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA8P48165 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA8P48165 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA8P48165 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA8P48165 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA8P48165 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA8P48165 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA8P48165 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA8P48165 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA8P48165 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA8P48165 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA8P48165 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA8P48165 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA8P48165 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA8P48165 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA8P48165 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA8P48165 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA8P48165 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA8P48165 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA8P48165 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA8P48165 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA8P48165 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA8P48165 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA8P48165 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA8P48165 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA8P48165 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA8P48165 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA8P48165 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA8P48165 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA8P48165 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA8P48165 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA8P48165 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA8P48165 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA8P48165 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA8P48165 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA8P48165 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA8P48165 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA8P48165 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA8P48165 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA8P48165 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA8P48165 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA8P48165 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA8P48165 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA8P48165 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA8P48165 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA8P48165 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA8P48165 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA8P48165 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA8P48165 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA8P48165 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA8P48165 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA8P48165 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA8P48165 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA8P48165 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA8P48165 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA8P48165 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA8P48165 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA8P48165 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA8P48165 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA8P48165 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA8P48165 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA8P48165 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA8P48165 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA8P48165 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA8P48165 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA8P48165 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA8P48165 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA8P48165 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA8P48165 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA8P48165 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA8P48165 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA8P48165 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA8P48165 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA8P48165 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA8P48165 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA8P48165 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA8P48165 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA8P48165 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA8P48165 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA8P48165 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms