Protein–RNA interactions for Protein: P46777

RPL5, 60S ribosomal protein L5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL5P46777 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL5P46777 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL5P46777 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL5P46777 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL5P46777 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL5P46777 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL5P46777 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL5P46777 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL5P46777 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL5P46777 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL5P46777 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL5P46777 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL5P46777 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL5P46777 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL5P46777 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL5P46777 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL5P46777 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL5P46777 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL5P46777 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL5P46777 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL5P46777 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL5P46777 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL5P46777 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL5P46777 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL5P46777 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL5P46777 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL5P46777 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL5P46777 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL5P46777 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL5P46777 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL5P46777 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL5P46777 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL5P46777 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL5P46777 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL5P46777 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL5P46777 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL5P46777 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPL5P46777 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPL5P46777 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPL5P46777 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL5P46777 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL5P46777 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL5P46777 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL5P46777 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL5P46777 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL5P46777 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL5P46777 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL5P46777 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL5P46777 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL5P46777 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL5P46777 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL5P46777 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL5P46777 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL5P46777 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL5P46777 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL5P46777 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL5P46777 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL5P46777 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL5P46777 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL5P46777 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL5P46777 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL5P46777 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPL5P46777 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPL5P46777 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL5P46777 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPL5P46777 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL5P46777 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL5P46777 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL5P46777 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL5P46777 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL5P46777 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL5P46777 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL5P46777 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL5P46777 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms