Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRXP46100 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRXP46100 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRXP46100 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRXP46100 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRXP46100 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRXP46100 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRXP46100 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRXP46100 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATRXP46100 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATRXP46100 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATRXP46100 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATRXP46100 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATRXP46100 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
ATRXP46100 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRXP46100 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRXP46100 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRXP46100 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRXP46100 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRXP46100 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRXP46100 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRXP46100 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRXP46100 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATRXP46100 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRXP46100 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRXP46100 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRXP46100 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRXP46100 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRXP46100 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRXP46100 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRXP46100 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRXP46100 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRXP46100 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRXP46100 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRXP46100 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRXP46100 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRXP46100 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRXP46100 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRXP46100 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRXP46100 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRXP46100 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRXP46100 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATRXP46100 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRXP46100 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRXP46100 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRXP46100 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRXP46100 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRXP46100 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRXP46100 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRXP46100 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRXP46100 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRXP46100 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRXP46100 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRXP46100 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRXP46100 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRXP46100 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRXP46100 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRXP46100 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATRXP46100 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATRXP46100 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRXP46100 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRXP46100 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRXP46100 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRXP46100 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRXP46100 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRXP46100 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRXP46100 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRXP46100 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRXP46100 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRXP46100 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRXP46100 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRXP46100 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRXP46100 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRXP46100 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATRXP46100 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRXP46100 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms