Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPD2P43304 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPD2P43304 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPD2P43304 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPD2P43304 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPD2P43304 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPD2P43304 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPD2P43304 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPD2P43304 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GPD2P43304 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GPD2P43304 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GPD2P43304 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GPD2P43304 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPD2P43304 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GPD2P43304 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPD2P43304 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPD2P43304 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPD2P43304 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPD2P43304 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPD2P43304 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPD2P43304 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPD2P43304 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPD2P43304 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPD2P43304 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPD2P43304 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPD2P43304 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPD2P43304 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPD2P43304 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPD2P43304 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPD2P43304 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GPD2P43304 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPD2P43304 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPD2P43304 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPD2P43304 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPD2P43304 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPD2P43304 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPD2P43304 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPD2P43304 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPD2P43304 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPD2P43304 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPD2P43304 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPD2P43304 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPD2P43304 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPD2P43304 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPD2P43304 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPD2P43304 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPD2P43304 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPD2P43304 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPD2P43304 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPD2P43304 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPD2P43304 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPD2P43304 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPD2P43304 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPD2P43304 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPD2P43304 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPD2P43304 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPD2P43304 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPD2P43304 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPD2P43304 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPD2P43304 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPD2P43304 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPD2P43304 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPD2P43304 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPD2P43304 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPD2P43304 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPD2P43304 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPD2P43304 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPD2P43304 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPD2P43304 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPD2P43304 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPD2P43304 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPD2P43304 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPD2P43304 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPD2P43304 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPD2P43304 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPD2P43304 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPD2P43304 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPD2P43304 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPD2P43304 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPD2P43304 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPD2P43304 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPD2P43304 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GPD2P43304 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPD2P43304 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPD2P43304 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GPD2P43304 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GPD2P43304 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPD2P43304 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GPD2P43304 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPD2P43304 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPD2P43304 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPD2P43304 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPD2P43304 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPD2P43304 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPD2P43304 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPD2P43304 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPD2P43304 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GPD2P43304 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPD2P43304 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPD2P43304 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms