Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRATP43155 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRATP43155 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRATP43155 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRATP43155 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRATP43155 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRATP43155 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRATP43155 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRATP43155 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRATP43155 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRATP43155 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRATP43155 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRATP43155 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRATP43155 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRATP43155 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRATP43155 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRATP43155 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRATP43155 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRATP43155 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRATP43155 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRATP43155 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRATP43155 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRATP43155 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRATP43155 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRATP43155 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRATP43155 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRATP43155 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRATP43155 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CRATP43155 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRATP43155 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRATP43155 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRATP43155 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRATP43155 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRATP43155 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRATP43155 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRATP43155 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRATP43155 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRATP43155 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRATP43155 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRATP43155 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRATP43155 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRATP43155 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRATP43155 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CRATP43155 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CRATP43155 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CRATP43155 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CRATP43155 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRATP43155 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRATP43155 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRATP43155 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRATP43155 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRATP43155 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRATP43155 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRATP43155 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRATP43155 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRATP43155 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRATP43155 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRATP43155 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRATP43155 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRATP43155 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRATP43155 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRATP43155 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRATP43155 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRATP43155 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CRATP43155 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRATP43155 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRATP43155 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRATP43155 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRATP43155 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRATP43155 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRATP43155 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRATP43155 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRATP43155 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRATP43155 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms